MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeromonas salmonicida salmonicida A449 plasmid pAsa1

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004923	GAT	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453761
2	NC_004923	GAC	2	6	1154	1159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453761
3	NC_004923	GGA	2	6	1169	1174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453761
4	NC_004923	GAG	2	6	1176	1181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453761
5	NC_004923	CTTGTT	2	12	1188	1199	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32453761
6	NC_004923	GGAA	2	8	1280	1287	50 %	0 %	50 %	0 %	32453762
7	NC_004923	GAA	2	6	1290	1295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32453762
8	NC_004923	CAG	2	6	1315	1320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453762
9	NC_004923	AAG	2	6	1327	1332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32453762
10	NC_004923	GAT	2	6	1447	1452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453762
11	NC_004923	GCC	2	6	1738	1743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453763
12	NC_004923	TCG	2	6	1748	1753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453763
13	NC_004923	CGA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453763
14	NC_004923	CCGC	2	8	1809	1816	0 %	0 %	25 %	75 %	32453763
15	NC_004923	CCG	2	6	1858	1863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453763
16	NC_004923	AGC	2	6	1907	1912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453763
17	NC_004923	CTG	2	6	2008	2013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453763
18	NC_004923	GAA	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32453763
19	NC_004923	TGG	2	6	2155	2160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453763
20	NC_004923	CCG	2	6	2241	2246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453763
21	NC_004923	GGC	2	6	2336	2341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453763
22	NC_004923	ACG	2	6	2351	2356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453763
23	NC_004923	GGC	2	6	2416	2421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453763
24	NC_004923	GGC	2	6	2477	2482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453763
25	NC_004923	GGC	2	6	2560	2565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453763
26	NC_004923	GCT	2	6	2607	2612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453763
27	NC_004923	GT	3	6	2690	2695	0 %	50 %	50 %	0 %	32453763
28	NC_004923	CCAT	2	8	2957	2964	25 %	25 %	0 %	50 %	32453764
29	NC_004923	CT	3	6	3005	3010	0 %	50 %	0 %	50 %	32453764
30	NC_004923	GCT	2	6	3057	3062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453764
31	NC_004923	GCT	2	6	3084	3089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453764
32	NC_004923	GTG	2	6	3150	3155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453764
33	NC_004923	ACC	2	6	3393	3398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32453765
34	NC_004923	CCG	3	9	3424	3432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453765
35	NC_004923	G	6	6	3484	3489	0 %	0 %	100 %	0 %	32453765
36	NC_004923	CAG	2	6	3504	3509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453765
37	NC_004923	CCGTC	2	10	3533	3542	0 %	20 %	20 %	60 %	32453765
38	NC_004923	CAA	2	6	3605	3610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32453765
39	NC_004923	TCG	2	6	3657	3662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453765
40	NC_004923	TGG	2	6	3670	3675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453765
41	NC_004923	CTG	2	6	3687	3692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453765
42	NC_004923	GCA	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453765
43	NC_004923	CTG	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453765
44	NC_004923	GCC	2	6	3734	3739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453765
45	NC_004923	CA	3	6	3847	3852	50 %	0 %	0 %	50 %	32453766
46	NC_004923	CAC	2	6	3857	3862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32453766
47	NC_004923	GTT	2	6	3897	3902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32453766
48	NC_004923	GCG	2	6	3904	3909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453766
49	NC_004923	CCG	2	6	3983	3988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453766
50	NC_004923	GGA	2	6	4008	4013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453766
51	NC_004923	CGG	2	6	4064	4069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453766
52	NC_004923	ACG	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453766
53	NC_004923	CCA	2	6	4159	4164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32453766
54	NC_004923	GAC	2	6	4231	4236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453766
55	NC_004923	GCC	2	6	4336	4341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453766
56	NC_004923	GCG	2	6	4363	4368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453766
57	NC_004923	CTAC	2	8	4380	4387	25 %	25 %	0 %	50 %	32453766
58	NC_004923	ATC	2	6	4491	4496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32453766
59	NC_004923	CAG	2	6	4502	4507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453766
60	NC_004923	AAGA	2	8	4598	4605	75 %	0 %	25 %	0 %	32453766
61	NC_004923	CGGGA	2	10	4655	4664	20 %	0 %	60 %	20 %	32453766
62	NC_004923	CGAC	2	8	4695	4702	25 %	0 %	25 %	50 %	32453766
63	NC_004923	AGG	2	6	4710	4715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453766
64	NC_004923	G	6	6	4827	4832	0 %	0 %	100 %	0 %	32453766
65	NC_004923	CAG	2	6	4879	4884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453766
66	NC_004923	CCGG	2	8	4910	4917	0 %	0 %	50 %	50 %	32453766
67	NC_004923	GGA	2	6	4933	4938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453766
68	NC_004923	CAC	2	6	5075	5080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32453766
69	NC_004923	GCA	2	6	5101	5106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453766
70	NC_004923	AC	3	6	5194	5199	50 %	0 %	0 %	50 %	32453766
71	NC_004923	GAGC	2	8	5230	5237	25 %	0 %	50 %	25 %	32453766
72	NC_004923	GACCA	2	10	5261	5270	40 %	0 %	20 %	40 %	32453766
73	NC_004923	CAG	2	6	5305	5310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453766
74	NC_004923	AGC	2	6	5393	5398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453766
75	NC_004923	GA	3	6	5400	5405	50 %	0 %	50 %	0 %	32453766

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.